陈寅恪先生每次上课，都用花布或黑布，包着一大包书，在课前匆匆走进教室，从不迟到。他总是先把要讲的内容满满地抄到两个黑板上，然后坐到讲台前的扶手椅上，开始讲课。他讲课的时候，总是能自己营造出一种境界来，带着你穿越数千年历史，置身于汉唐时期的繁华盛世中。他喜欢闭着眼睛讲课，让自己也沉浸在那种历史语境中。
在西南联大时，他的右眼视网膜已经剥离，左眼仅剩微弱视力。有一天上课时，他先在黑板上写好了所要讲的重点，然后坐到扶手椅上开始闭着眼睛讲课，但那天因为学生打扫卫生，把本来面朝学生的扶手椅放反了，陈寅恪先生没能觉察到，就坐下来，面朝黑板，背对着学生开始讲课，讲了好久才发觉方向不对，于是站起来搬转座椅，微笑着坐下来继续讲。
他记忆力特别惊人，讲课时所引用的知识，从不用翻书，张口就来，如数家珍，而且连出处都说得明明白白，有好奇的学生记下了他所引用的资料，过后到图书馆一查，果然一点不差。有一回上课，学生王永兴读课文至某一段，端坐在椅子上的陈寅恪突然把手一挥，示意他停下来，并要求重读，王永兴知道很可能是哪个地方脱漏了，再重新一字一句慢慢地读，果然发现刚才脱漏了一个字。
陈寅恪先生讲课，提出所讲专题后，逐层展开，每堂课都以新资料印证旧闻，或于平常所见史籍中发现新见解，对于外国学者的见解，也逐次引用，有时一堂课上要引用多种外国文字，他的学生陈哲三回忆说：“陈先生演讲，同学显得程度很不够。他所会业已死了的文字，拉丁文不必讲，如梵文、巴利文、满文、蒙文、藏文、突厥文、西夏文及中波斯文非常之多，至于英、法、德、俄、日、希腊诸国文更不用说，甚至连匈牙利的马扎儿文也懂。上课时我们常常听不懂，他一写，哦！才知哪是德文，哪是梵文，但要问其音叩其义方始完全了解。”
陈寅恪先生讲课，并不是填鸭式的满堂灌，而是有意为学生留下思索的空间，使学生能够自由思考一些问题，燕大历史系学生雍国泰回忆：“先生讲的内容是唐史，他声音细微，语音不清之处，或者一些中心词，都由讲师板书在黑板上。我注意细听他的每一句话，也作了笔记。概括来说，他讲的章节，无系统，想到哪就说到哪里，这一周讲了半截，下一周又讲到其他方面去了，留出巨大的空间，让我们自己去思考和填补。”
由于陈寅恪讲课内容精辟，极富启发性，所以，不仅校内的学生，就连外校的学生、教授都来听课。
